Michael Rutz studierte von 1972 bis 1976 Wirtschafts- und Rechtswissenschaften in Würzburg. Nach seiner Diplomprüfung trat er 1976 in die Wirtschaftsredaktion Hörfunk des Bayerischen Rundfunks in München ein. Zwischen 1979 und 1981 berichtete er als Auslandskorrespondent Hörfunk zunächst aus den USA und dann aus Großbritannien.
1982 arbeitete er als Referent des BR-Rundfunkrates. 1985 übernahm er die Leitung der Wirtschaftsredaktion im Hörfunk des BR. 1987 wurde er stellvertretender Chefredakteur und Leiter der Hauptabteilung Politik und Zeitgeschehen des Bayerischen Fernsehens. 1989 nahm er ein Angebot des Privatsenders Sat.1 an und wurde dessen Chefredakteur. Fünf Jahre später ging er in gleicher Funktion zur politischen Wochenzeitung Rheinischer Merkur. Beim Rheinischen Merkur blieb er bis zu dessen Verkauf im Jahr 2010.
Einen Namen in seiner Branche und weit darüber hinaus machte sich Michael Rutz nicht nur als Hörfunk- und Printjournalist, sondern auch als Autor zahlreicher Fernsehfilme. So porträtierte er für die ARD beispielsweise Politiker wie Helmut Kohl, Wolfgang Schäuble und Angela Merkel.
Als Autor und Herausgeber zahlreicher Bücher befasst er sich mit Themen der Bildungs-, Wirtschafts-, Sozial- und Außenpolitik sowie mit den Auswirkungen der Informationstechnologien auf unsere Gesellschaft. Sein besonderes Interesse gilt der Geschichte und Gegenwart Europas.
2011 gründete er die Prof. Rutz Communications GmbH sowie 2018 zusätzlich die Faktor 3 Public Sense GmbH, beide mit Sitz in Berlin, deren geschäftsführender Gesellschafter er jeweils ist.
Als Vorstandsmitglied des Deutsch-Russischen Forums (DRF) arbeitet er an der Verbesserung der zivilgesellschaftlichen Beziehungen zwischen beiden Ländern mit. Im aktiven Naturschutz engagiert er sich als Vorstandsmitglied im Verein Naturschutzpark (VNP) in der Lüneburger Heide. Seit 2018 ist Rutz auch Präsident der Guardini-Stiftung e.V., Berlin. 2020 wurde er in den Vorstand der Stiftung Demoskopie Allensbach berufen.
Michael Rutz ist Honorarprofessor für Fernsehlehre an der Hochschule Mittweida.